Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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