Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shisa3Q3UPR0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shisa3Q3UPR0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shisa3Q3UPR0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shisa3Q3UPR0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shisa3Q3UPR0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shisa3Q3UPR0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shisa3Q3UPR0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shisa3Q3UPR0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shisa3Q3UPR0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shisa3Q3UPR0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shisa3Q3UPR0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shisa3Q3UPR0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shisa3Q3UPR0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shisa3Q3UPR0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shisa3Q3UPR0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shisa3Q3UPR0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shisa3Q3UPR0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shisa3Q3UPR0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shisa3Q3UPR0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shisa3Q3UPR0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shisa3Q3UPR0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shisa3Q3UPR0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shisa3Q3UPR0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shisa3Q3UPR0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shisa3Q3UPR0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shisa3Q3UPR0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shisa3Q3UPR0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shisa3Q3UPR0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shisa3Q3UPR0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shisa3Q3UPR0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shisa3Q3UPR0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa3Q3UPR0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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