Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
LbrQ3U9G9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms