Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms