Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas2P97460 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas2P97460 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas2P97460 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms