Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms