Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx3P81067 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx3P81067 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx3P81067 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx3P81067 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx3P81067 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms