Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ufm1P61961 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ufm1P61961 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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