Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Mmp9P41245 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Mmp9P41245 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Mmp9P41245 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Mmp9P41245 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Mmp9P41245 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Mmp9P41245 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Mmp9P41245 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Mmp9P41245 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Mmp9P41245 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Mmp9P41245 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Mmp9P41245 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Mmp9P41245 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Mmp9P41245 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Mmp9P41245 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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