Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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