Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms