Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms