Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04214 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04214 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04214 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04214 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04214 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04214 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P04214 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04214 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04214 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04214 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04214 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04214 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04214 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04214 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P04214 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P04214 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P04214 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P04214 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P04214 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P04214 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P04214 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P04214 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P04214 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P04214 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P04214 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P04214 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P04214 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P04214 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P04214 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
P04214 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P04214 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P04214 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P04214 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P04214 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P04214 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P04214 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P04214 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P04214 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P04214 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P04214 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P04214 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P04214 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P04214 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P04214 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P04214 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P04214 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P04214 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P04214 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P04214 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P04214 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P04214 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P04214 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P04214 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P04214 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P04214 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P04214 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P04214 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P04214 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P04214 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P04214 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P04214 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P04214 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P04214 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P04214 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P04214 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P04214 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P04214 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P04214 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P04214 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P04214 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04214 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04214 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04214 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04214 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04214 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04214 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04214 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04214 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04214 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04214 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04214 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04214 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04214 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P04214 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04214 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04214 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04214 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04214 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04214 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04214 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04214 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04214 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04214 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04214 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04214 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04214 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04214 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04214 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P04214 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms