Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01648 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01648 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01648 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01648 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01648 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01648 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01648 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01648 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01648 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01648 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01648 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01648 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01648 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01648 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01648 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01648 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01648 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01648 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01648 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01648 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01648 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01648 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01648 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01648 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01648 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01648 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01648 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01648 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01648 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01648 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01648 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01648 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01648 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01648 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01648 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01648 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01648 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01648 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01648 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01648 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01648 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01648 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01648 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01648 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01648 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01648 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01648 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01648 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01648 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01648 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01648 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01648 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01648 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01648 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01648 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01648 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01648 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01648 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01648 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01648 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01648 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01648 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01648 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01648 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01648 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01648 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01648 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01648 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01648 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01648 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01648 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01648 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01648 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01648 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01648 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01648 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01648 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01648 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01648 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01648 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01648 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01648 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01648 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01648 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01648 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01648 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01648 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01648 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01648 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01648 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01648 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01648 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01648 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01648 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01648 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01648 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01648 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01648 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01648 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms