Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
F11rO88792 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
F11rO88792 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
F11rO88792 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
F11rO88792 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
F11rO88792 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
F11rO88792 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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F11rO88792 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
F11rO88792 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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F11rO88792 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F11rO88792 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F11rO88792 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
F11rO88792 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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F11rO88792 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F11rO88792 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
F11rO88792 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F11rO88792 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
F11rO88792 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F11rO88792 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
F11rO88792 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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F11rO88792 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F11rO88792 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F11rO88792 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F11rO88792 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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F11rO88792 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F11rO88792 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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F11rO88792 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F11rO88792 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
F11rO88792 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F11rO88792 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F11rO88792 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
F11rO88792 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F11rO88792 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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F11rO88792 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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F11rO88792 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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F11rO88792 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
F11rO88792 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F11rO88792 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F11rO88792 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
F11rO88792 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
F11rO88792 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F11rO88792 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F11rO88792 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F11rO88792 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
F11rO88792 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F11rO88792 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F11rO88792 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F11rO88792 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F11rO88792 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F11rO88792 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F11rO88792 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F11rO88792 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F11rO88792 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F11rO88792 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F11rO88792 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F11rO88792 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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