Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja1O55176 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja1O55176 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja1O55176 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja1O55176 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja1O55176 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja1O55176 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja1O55176 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja1O55176 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja1O55176 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms