Protein–RNA interactions for Protein: O55038

Cxcl13, C-X-C motif chemokine 13, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl13O55038 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
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Cxcl13O55038 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl13O55038 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl13O55038 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl13O55038 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl13O55038 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl13O55038 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Cxcl13O55038 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl13O55038 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl13O55038 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Cxcl13O55038 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl13O55038 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Cxcl13O55038 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Cxcl13O55038 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Cxcl13O55038 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Cxcl13O55038 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Cxcl13O55038 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl13O55038 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Cxcl13O55038 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl13O55038 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cxcl13O55038 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl13O55038 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl13O55038 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl13O55038 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cxcl13O55038 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cxcl13O55038 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl13O55038 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl13O55038 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl13O55038 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl13O55038 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl13O55038 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl13O55038 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl13O55038 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl13O55038 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl13O55038 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl13O55038 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl13O55038 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl13O55038 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl13O55038 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl13O55038 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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