Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf9O35739 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf9O35739 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf9O35739 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf9O35739 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf9O35739 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf9O35739 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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