Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20834J3QM72 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20834J3QM72 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20834J3QM72 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20834J3QM72 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20834J3QM72 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20834J3QM72 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20834J3QM72 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20834J3QM72 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20834J3QM72 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20834J3QM72 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20834J3QM72 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20834J3QM72 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20834J3QM72 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20834J3QM72 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20834J3QM72 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20834J3QM72 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms