Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmgxb3G3X9M3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms