Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM2

Ccl26, Chemokine (C-C motif) ligand 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl26F8VQM2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms