Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms