Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms