Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms