Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms