Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms