Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pja2Q80U04 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms