Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms