Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
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Lrrn2Q6PHP6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Lrrn2Q6PHP6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrn2Q6PHP6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrn2Q6PHP6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrn2Q6PHP6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrn2Q6PHP6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrn2Q6PHP6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrn2Q6PHP6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrn2Q6PHP6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrn2Q6PHP6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrn2Q6PHP6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrn2Q6PHP6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms