Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhb9Q6PB60 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhb9Q6PB60 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhb9Q6PB60 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhb9Q6PB60 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhb9Q6PB60 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhb9Q6PB60 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhb9Q6PB60 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhb9Q6PB60 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhb9Q6PB60 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhb9Q6PB60 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhb9Q6PB60 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhb9Q6PB60 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhb9Q6PB60 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhb9Q6PB60 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhb9Q6PB60 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhb9Q6PB60 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhb9Q6PB60 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhb9Q6PB60 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhb9Q6PB60 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhb9Q6PB60 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhb9Q6PB60 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhb9Q6PB60 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhb9Q6PB60 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhb9Q6PB60 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhb9Q6PB60 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhb9Q6PB60 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhb9Q6PB60 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhb9Q6PB60 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhb9Q6PB60 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhb9Q6PB60 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms