Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top2bQ64511 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms