Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc18Q640L5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc18Q640L5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
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