Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms