Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lamb3Q61087 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms