Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms