Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Chsy3Q5DTK1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Chsy3Q5DTK1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Chsy3Q5DTK1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Chsy3Q5DTK1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chsy3Q5DTK1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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