Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
E330034G19RikQ3UWX6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
E330034G19RikQ3UWX6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
E330034G19RikQ3UWX6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
E330034G19RikQ3UWX6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms