Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.08■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.08■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.08■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E330014E10RikQ3UL33 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms