Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms