Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAP4

Ap5b1, AP-5 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5b1Q3TAP4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ap5b1Q3TAP4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ap5b1Q3TAP4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ap5b1Q3TAP4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ap5b1Q3TAP4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ap5b1Q3TAP4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ap5b1Q3TAP4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ap5b1Q3TAP4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ap5b1Q3TAP4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ap5b1Q3TAP4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ap5b1Q3TAP4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap5b1Q3TAP4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ap5b1Q3TAP4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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