Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms