Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms