Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms