Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SeleQ00690 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SeleQ00690 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SeleQ00690 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SeleQ00690 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SeleQ00690 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SeleQ00690 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms