Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apoa1Q00623 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms