Protein–RNA interactions for Protein: P54254

Atxn1, Ataxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn1P54254 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn1P54254 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn1P54254 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn1P54254 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn1P54254 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn1P54254 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn1P54254 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn1P54254 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn1P54254 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn1P54254 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn1P54254 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn1P54254 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn1P54254 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn1P54254 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn1P54254 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn1P54254 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn1P54254 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn1P54254 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn1P54254 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn1P54254 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn1P54254 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn1P54254 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn1P54254 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms