Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BgnP28653 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BgnP28653 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BgnP28653 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BgnP28653 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BgnP28653 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BgnP28653 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BgnP28653 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BgnP28653 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BgnP28653 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BgnP28653 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BgnP28653 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BgnP28653 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BgnP28653 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BgnP28653 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BgnP28653 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BgnP28653 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BgnP28653 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BgnP28653 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BgnP28653 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BgnP28653 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BgnP28653 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BgnP28653 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BgnP28653 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BgnP28653 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BgnP28653 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BgnP28653 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BgnP28653 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BgnP28653 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BgnP28653 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BgnP28653 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BgnP28653 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BgnP28653 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BgnP28653 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BgnP28653 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BgnP28653 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BgnP28653 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BgnP28653 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BgnP28653 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BgnP28653 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BgnP28653 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BgnP28653 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BgnP28653 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BgnP28653 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BgnP28653 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BgnP28653 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BgnP28653 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BgnP28653 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BgnP28653 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BgnP28653 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BgnP28653 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BgnP28653 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BgnP28653 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BgnP28653 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BgnP28653 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BgnP28653 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BgnP28653 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BgnP28653 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BgnP28653 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BgnP28653 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BgnP28653 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BgnP28653 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BgnP28653 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BgnP28653 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BgnP28653 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BgnP28653 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BgnP28653 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BgnP28653 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BgnP28653 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BgnP28653 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BgnP28653 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BgnP28653 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BgnP28653 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BgnP28653 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BgnP28653 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BgnP28653 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BgnP28653 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BgnP28653 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BgnP28653 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BgnP28653 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
BgnP28653 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BgnP28653 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BgnP28653 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BgnP28653 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BgnP28653 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BgnP28653 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BgnP28653 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BgnP28653 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BgnP28653 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
BgnP28653 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BgnP28653 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BgnP28653 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BgnP28653 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
BgnP28653 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BgnP28653 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BgnP28653 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BgnP28653 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BgnP28653 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BgnP28653 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BgnP28653 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms