Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ntf3P20181 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ntf3P20181 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ntf3P20181 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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