Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18532 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18532 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18532 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18532 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18532 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18532 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18532 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18532 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18532 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18532 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18532 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18532 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18532 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18532 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18532 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18532 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P18532 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P18532 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18532 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18532 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18532 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P18532 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18532 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18532 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18532 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18532 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18532 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18532 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18532 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18532 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18532 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18532 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18532 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18532 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18532 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18532 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18532 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18532 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18532 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18532 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18532 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18532 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18532 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18532 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18532 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18532 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18532 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18532 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18532 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18532 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18532 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P18532 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18532 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18532 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18532 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18532 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18532 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18532 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18532 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms