Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A1P13866 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A1P13866 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A1P13866 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A1P13866 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A1P13866 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A1P13866 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A1P13866 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A1P13866 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A1P13866 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A1P13866 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A1P13866 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A1P13866 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A1P13866 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A1P13866 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A1P13866 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A1P13866 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A1P13866 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC5A1P13866 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms